Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Dkk3Q9QUN9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms