Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms