Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrfQ9JM73 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SrfQ9JM73 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrfQ9JM73 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms