Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rabgef1Q9JM13 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
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Rabgef1Q9JM13 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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