Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Cabp1Q9JLK7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Cabp1Q9JLK7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Cabp1Q9JLK7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cabp1Q9JLK7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cabp1Q9JLK7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cabp1Q9JLK7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cabp1Q9JLK7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cabp1Q9JLK7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cabp1Q9JLK7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cabp1Q9JLK7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Cabp1Q9JLK7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Cabp1Q9JLK7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Cabp1Q9JLK7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Cabp1Q9JLK7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Cabp1Q9JLK7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cabp1Q9JLK7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cabp1Q9JLK7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cabp1Q9JLK7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cabp1Q9JLK7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cabp1Q9JLK7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms