Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufaf3Q9JKL4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms