Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
AtrQ9JKK8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AtrQ9JKK8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms