Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms