Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nectin1Q9JKF6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms