Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ybx3Q9JKB3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ybx3Q9JKB3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ybx3Q9JKB3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms