Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uchl3Q9JKB1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms