Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms