Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cacng4Q9JJV4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacng4Q9JJV4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacng4Q9JJV4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.4 ms