Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gfra4Q9JJT2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gfra4Q9JJT2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms