Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 510.7 ms