Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmbr1Q9JIT0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms