Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup50Q9JIH2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms