Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cxcl11Q9JHH5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cxcl11Q9JHH5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxcl11Q9JHH5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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