Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnfrsf13bQ9ET35 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf13bQ9ET35 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms