Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tm9sf3Q9ET30 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tm9sf3Q9ET30 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tm9sf3Q9ET30 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tm9sf3Q9ET30 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tm9sf3Q9ET30 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tm9sf3Q9ET30 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tm9sf3Q9ET30 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tm9sf3Q9ET30 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tm9sf3Q9ET30 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tm9sf3Q9ET30 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tm9sf3Q9ET30 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tm9sf3Q9ET30 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tm9sf3Q9ET30 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tm9sf3Q9ET30 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tm9sf3Q9ET30 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tm9sf3Q9ET30 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms