Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Rb1cc1Q9ESK9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC39.26■■■■□ 3.87
Rb1cc1Q9ESK9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Rb1cc1Q9ESK9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Rb1cc1Q9ESK9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Rb1cc1Q9ESK9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Rb1cc1Q9ESK9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Rb1cc1Q9ESK9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Rb1cc1Q9ESK9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Rb1cc1Q9ESK9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Rb1cc1Q9ESK9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Rb1cc1Q9ESK9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Rb1cc1Q9ESK9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Rb1cc1Q9ESK9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Rb1cc1Q9ESK9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Rb1cc1Q9ESK9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Rb1cc1Q9ESK9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
Rb1cc1Q9ESK9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Rb1cc1Q9ESK9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Rb1cc1Q9ESK9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Rb1cc1Q9ESK9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Rb1cc1Q9ESK9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Rb1cc1Q9ESK9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
Rb1cc1Q9ESK9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Rb1cc1Q9ESK9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Rb1cc1Q9ESK9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Rb1cc1Q9ESK9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Rb1cc1Q9ESK9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Rb1cc1Q9ESK9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Rb1cc1Q9ESK9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms