Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR5

Lime1, Lck-interacting transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lime1Q9EQR5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lime1Q9EQR5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lime1Q9EQR5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lime1Q9EQR5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lime1Q9EQR5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lime1Q9EQR5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lime1Q9EQR5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lime1Q9EQR5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lime1Q9EQR5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lime1Q9EQR5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lime1Q9EQR5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lime1Q9EQR5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lime1Q9EQR5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lime1Q9EQR5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lime1Q9EQR5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lime1Q9EQR5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms