Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
V1ra8Q9EQ48 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms