Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr6Q9EQ16 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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