Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPT1

Vmn1r63, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r63Q9EPT1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r63Q9EPT1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r63Q9EPT1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r63Q9EPT1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r63Q9EPT1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r63Q9EPT1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r63Q9EPT1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r63Q9EPT1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r63Q9EPT1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r63Q9EPT1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r63Q9EPT1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r63Q9EPT1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r63Q9EPT1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r63Q9EPT1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r63Q9EPT1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r63Q9EPT1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r63Q9EPT1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r63Q9EPT1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r63Q9EPT1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r63Q9EPT1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r63Q9EPT1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r63Q9EPT1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r63Q9EPT1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r63Q9EPT1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r63Q9EPT1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r63Q9EPT1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r63Q9EPT1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r63Q9EPT1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r63Q9EPT1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r63Q9EPT1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r63Q9EPT1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r63Q9EPT1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r63Q9EPT1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r63Q9EPT1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r63Q9EPT1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r63Q9EPT1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms