Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SyncQ9EPM5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SyncQ9EPM5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SyncQ9EPM5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms