Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnft1Q9DCN7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms