Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3fQ9DCH4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3fQ9DCH4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms