Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trmt112Q9DCG9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trmt112Q9DCG9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms