Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp27a1Q9DBG1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms