Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ftsj3Q9DBE9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ftsj3Q9DBE9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms