Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms