Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smco2Q9DA21 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smco2Q9DA21 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms