Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg7Q9D906 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms