Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot8Q9D8X5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.9 ms