Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo2Q9D8S4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms