Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M8

Polr2d, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2dQ9D7M8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2dQ9D7M8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2dQ9D7M8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2dQ9D7M8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2dQ9D7M8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2dQ9D7M8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2dQ9D7M8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2dQ9D7M8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2dQ9D7M8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2dQ9D7M8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2dQ9D7M8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2dQ9D7M8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2dQ9D7M8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms