Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capns2Q9D7J7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capns2Q9D7J7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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