Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp4cQ9D7F7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms