Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc94Q9D6J3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc94Q9D6J3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms