Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cmtm5Q9D6G9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cmtm5Q9D6G9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cmtm5Q9D6G9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cmtm5Q9D6G9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cmtm5Q9D6G9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cmtm5Q9D6G9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cmtm5Q9D6G9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cmtm5Q9D6G9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cmtm5Q9D6G9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cmtm5Q9D6G9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cmtm5Q9D6G9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cmtm5Q9D6G9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cmtm5Q9D6G9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cmtm5Q9D6G9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cmtm5Q9D6G9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cmtm5Q9D6G9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cmtm5Q9D6G9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cmtm5Q9D6G9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cmtm5Q9D6G9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cmtm5Q9D6G9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms