Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc7Q9D541 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc7Q9D541 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms