Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc83Q9D4V3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms