Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Syce1Q9D495 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms