Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pus10Q9D3U0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pus10Q9D3U0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pus10Q9D3U0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pus10Q9D3U0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pus10Q9D3U0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pus10Q9D3U0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pus10Q9D3U0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pus10Q9D3U0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pus10Q9D3U0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pus10Q9D3U0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pus10Q9D3U0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pus10Q9D3U0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pus10Q9D3U0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms