Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stag1Q9D3E6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Stag1Q9D3E6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms