Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700034E13RikQ9D2T6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700034E13RikQ9D2T6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms