Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syf2Q9D198 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syf2Q9D198 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms