Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Susd3Q9D176 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Susd3Q9D176 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms