Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Arv1Q9D0U9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Arv1Q9D0U9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Arv1Q9D0U9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arv1Q9D0U9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arv1Q9D0U9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arv1Q9D0U9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arv1Q9D0U9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arv1Q9D0U9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arv1Q9D0U9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arv1Q9D0U9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arv1Q9D0U9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arv1Q9D0U9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arv1Q9D0U9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arv1Q9D0U9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arv1Q9D0U9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms